20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  100 
 
 		 150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  48.46 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  48.46 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  48.46 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  48.46 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  47.69 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  52.07 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  40 
 
 		 170 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  41.26 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  28.12 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  28.12 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  30 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.17 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  28.46 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  28.24 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  35.71 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  31.75 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  27.78 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  27.91 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  27.91 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>