18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2457 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2506  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  254  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2457  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  254  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  71.65 
 
 
128 aa  201  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  36.21 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  31.36 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  33.61 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  25.22 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  24.59 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  24.59 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4307  GtrA family protein  25 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  25.86 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0691  GtrA family protein  24.56 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.329569  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  28.71 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  28.95 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  29.31 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  29.31 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.31 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  28.28 
 
 
131 aa  40  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>