More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4403 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
235 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
245 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
245 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
257 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
241 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
239 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2963  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
787 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0080512  hitchhiker  0.000919293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
441 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
613 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
393 aa  89  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.2 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
334 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1898  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
394 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  28.99 
 
 
435 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
586 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
318 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
606 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  27.66 
 
 
574 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
568 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
319 aa  82  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.8 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  27.51 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  32.42 
 
 
328 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.2 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  29.72 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.57 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  28.81 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  30 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.5 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.16 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
496 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  31.72 
 
 
883 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  29.36 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
331 aa  75.5  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
343 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.16 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.75 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  26.44 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2546  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0757946  normal  0.0982432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
412 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>