More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1898 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1898  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
248 aa  517  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
278 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2752  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
242 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0672853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  27.68 
 
 
331 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
234 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1995  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0240903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  30.14 
 
 
328 aa  89  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
314 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  27.19 
 
 
332 aa  88.6  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
336 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
358 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
320 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
434 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
321 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
329 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
310 aa  86.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
325 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
320 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
344 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.75 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14031  hypothetical protein  28.89 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.97 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  28.37 
 
 
347 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
335 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
341 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
314 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
685 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  26.26 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  24.34 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.64 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  26.79 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  27.03 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
235 aa  79  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
386 aa  79  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  28.48 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  26.58 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  29.76 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  27.63 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
343 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  26.57 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
568 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>