More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1995 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1995  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 230 aa  480  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0240903 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14031  hypothetical protein  46.72 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2752  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0672853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1898  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  29.28 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  26.67 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.44 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 314 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  24.68 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  41.41 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  41.41 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2535  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  35.05 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.46 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  38.38 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16771  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  26.34 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.05 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.85 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  37.37 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1589  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.34 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.85 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.85 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1376  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0850607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  32.67 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  37.25 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  32.65 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16881  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  35.42 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0170  glycosyltransferase-like protein  35.71 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000142505  hitchhiker  7.37395e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.88 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  36.89 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  37.37 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  26.46 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  25.11 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.34 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  34.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  34.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>