More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2546 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2546  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
253 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0757946  normal  0.0982432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5100  glycosyl transferase family 2  68.29 
 
 
247 aa  361  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2887  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
247 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1868  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
720 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
241 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
278 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2963  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
787 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0080512  hitchhiker  0.000919293 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
340 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.96 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
414 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.32 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.81 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1898  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  23.32 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.43 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  23.89 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.72 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2381  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.03 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  26.24 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.36 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  27.01 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.31 
 
 
780 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  25.31 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0102  glycosyltransferase-like protein  24.9 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.59 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  23.41 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3721  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
338 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 
789 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  25.46 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 
789 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 
789 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
401 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  26.27 
 
 
749 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
351 aa  63.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  24.89 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
320 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0554  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.33 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  25.86 
 
 
310 aa  62  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
272 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.18 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  33.33 
 
 
321 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
434 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
391 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  37.04 
 
 
423 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>