More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5100 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5100  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2546  glycosyl transferase family 2  68.29 
 
 
253 aa  361  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0757946  normal  0.0982432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2887  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1868  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
720 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.97 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  25.64 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.15 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.44 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.69 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.98 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.73 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
411 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
227 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.88 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.35 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.1 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.42 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.88 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2963  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
787 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0080512  hitchhiker  0.000919293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  21.66 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  26.29 
 
 
749 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 
340 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  21.76 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.36 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.35 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  27.35 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  23.11 
 
 
883 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  26.44 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
420 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.08 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.92 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.16 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  27.57 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
414 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.24 
 
 
809 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0549  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.925315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.45 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
324 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
351 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  20.74 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
336 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
320 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
336 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.97 
 
 
780 aa  62.4  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25 
 
 
271 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  20.48 
 
 
327 aa  62  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  21.25 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.45 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.61 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.53 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  21.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
313 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>