More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1868 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1868  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
720 aa  1476    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1869  hypothetical protein  67.88 
 
 
491 aa  678    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2887  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
247 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2546  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 
253 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0757946  normal  0.0982432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5100  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
247 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
341 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  29.81 
 
 
331 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
342 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2506  hypothetical protein  25.57 
 
 
738 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364109  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
229 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
258 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
331 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
377 aa  65.1  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
347 aa  65.1  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
241 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
310 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
312 aa  64.7  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.51 
 
 
243 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
240 aa  64.7  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
420 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  25.12 
 
 
310 aa  64.3  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.14 
 
 
327 aa  64.3  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
248 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.65 
 
 
240 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2963  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
787 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0080512  hitchhiker  0.000919293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.79 
 
 
339 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
319 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
320 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
344 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  27.64 
 
 
330 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2381  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
313 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
258 aa  63.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
325 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
364 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
414 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
240 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  27.64 
 
 
330 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
366 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
334 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
251 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
336 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
249 aa  62  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
242 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
340 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
278 aa  61.6  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
311 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
311 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
284 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.84 
 
 
322 aa  61.2  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  30.3 
 
 
320 aa  61.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
237 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
237 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.16 
 
 
327 aa  60.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
320 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
339 aa  60.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
254 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
334 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
336 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
327 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  31.85 
 
 
249 aa  60.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
327 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
336 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
237 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  27.17 
 
 
308 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30 
 
 
327 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
327 aa  59.7  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
327 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
242 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
343 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30 
 
 
327 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  23.59 
 
 
312 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
327 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
314 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
312 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
369 aa  59.3  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 
319 aa  58.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  24.39 
 
 
237 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
246 aa  58.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  23.94 
 
 
234 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
252 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
320 aa  58.9  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
244 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
339 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
320 aa  58.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
249 aa  58.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
312 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
411 aa  58.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0299  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
342 aa  58.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
251 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
351 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.44 
 
 
326 aa  58.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>