286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2715 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  91.39 
 
 		 395 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 395 aa  777    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  91.14 
 
 		 395 aa  630  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  70.38 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  47.91 
 
 		 410 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  43.86 
 
 		 393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  41.04 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  43 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.25 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2374  glycosyl transferase family protein  45.35 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 401 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.21 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.71 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.39 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.85 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  23.75 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  26.76 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  23.69 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.28 
 
 		 1115 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.48 
 
 		 1115 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 752 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.19 
 
 		 1115 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.19 
 
 		 927 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.77 
 
 		 1115 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.19 
 
 		 1119 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  42.24 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  21.91 
 
 		 872 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  22.75 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  20.75 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  40.57 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  21.78 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  20.75 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  20.75 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  20.75 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 1002 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  20.44 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  21.78 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.42 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 1154 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  20.56 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  23.69 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  43.82 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.92 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.91 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 777 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  21.28 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  41.57 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 		 1120 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 228 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  26 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  26 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27610  glycosyl transferase  27.78 
 
 		 629 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  26 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>