More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2905 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 395 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  68.86 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  69.87 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  70.38 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 		 410 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  45.59 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  43.12 
 
 		 393 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2374  glycosyl transferase family protein  40.97 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.64 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 401 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.45 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.94 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.45 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.43 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.09 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.55 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  27.5 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 450 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  24.94 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 1002 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 1120 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 752 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  21.61 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  23.86 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 1101 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.15 
 
 		 1099 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  25.31 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  24.58 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.24 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  24 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  35.11 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.24 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.27 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 658 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  24.01 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.39 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.39 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.39 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.79 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0985  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  hitchhiker  0.00119227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.99 
 
 		 1154 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  24.03 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  24.03 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  39.66 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.9 
 
 		 1115 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.6 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 279 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  38.04 
 
 		 233 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 230 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>