More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0967 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  56.89 
 
 
312 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3186  glycosyl transferase family 2  56.54 
 
 
322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  40.99 
 
 
302 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2546  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
304 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3567  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
306 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
307 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2871  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
330 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2963  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
330 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2775  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4273  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
282 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0722  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
294 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.178232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1115  glycosyltransferase  29.03 
 
 
318 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
285 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  26.41 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.16 
 
 
1099 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
475 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  27.85 
 
 
412 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.02 
 
 
442 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3497  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
496 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  31.33 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
1120 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  27.47 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
412 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  26.97 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  34.15 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.42 
 
 
441 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
441 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
398 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
386 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
412 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
441 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.42 
 
 
441 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
441 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.85 
 
 
399 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.85 
 
 
399 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
367 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
386 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
1118 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
345 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
464 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
391 aa  55.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  26.67 
 
 
481 aa  55.8  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
479 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  29.75 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.5 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  29.07 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
1002 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.46 
 
 
442 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
379 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.95 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.66 
 
 
872 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
479 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.25 
 
 
1154 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
497 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
479 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  24.66 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.4 
 
 
927 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
330 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  24.4 
 
 
1115 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.4 
 
 
1119 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.4 
 
 
1115 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 
386 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.88 
 
 
341 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.6 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
374 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
573 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
305 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
314 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.21 
 
 
1115 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
338 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.42 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 
395 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>