235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2342 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
307 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2871  glycosyl transferase family 2  60.06 
 
 
330 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2963  glycosyl transferase family 2  59.74 
 
 
330 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4273  glycosyl transferase family protein  58.78 
 
 
310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2775  glycosyl transferase family protein  55.25 
 
 
332 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3567  glycosyl transferase family 2  46.53 
 
 
306 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2546  glycosyl transferase family 2  45.89 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
312 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
302 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3186  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
322 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
288 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
282 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  30.77 
 
 
285 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0722  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
294 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.178232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1115  glycosyltransferase  26.19 
 
 
318 aa  95.5  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
584 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
1032 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.19 
 
 
412 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  34.09 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  23.34 
 
 
425 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  23.34 
 
 
425 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.84 
 
 
377 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0960  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
278 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
485 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
485 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
485 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  30.66 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.48 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  30.88 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
397 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  24.46 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  33.71 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  22.34 
 
 
424 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 
327 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
327 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.97 
 
 
327 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.97 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.97 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.97 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
535 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.97 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
1562 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.23 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  40 
 
 
1148 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  30.68 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  27.42 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  28.95 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26101  putative glycosyl transferase  26.19 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  24.34 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  22.9 
 
 
399 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  22.9 
 
 
399 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  22.09 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  37.5 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.94 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  32.43 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  26.87 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
294 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  27.48 
 
 
353 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  27.52 
 
 
344 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
280 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
300 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
282 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  24.48 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
317 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
1116 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.56 
 
 
970 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  27.52 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.19 
 
 
451 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  28.83 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.97 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  27.52 
 
 
344 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>