More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0072 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 282 aa  587  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  54.02 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  52.69 
 
 		 288 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  43.68 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  43.45 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  45.63 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  46.39 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  45.77 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  44.31 
 
 		 516 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  45.34 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  41.96 
 
 		 515 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  39.75 
 
 		 259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  31.97 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  31.65 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  31.65 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  25.85 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.94 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.32 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.64 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 1035 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 289 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  33.67 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  22.86 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13951  putative glycosyl transferase  27.19 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.759655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.89 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.73 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  37 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25.2 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  24.67 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.06 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  34.31 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  35.16 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1715  protein CgeD  33.33 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  30.56 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  37.11 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 392 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.46 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  31.13 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  24.61 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.07 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2126  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3188  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>