More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06135 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  100 
 
 
272 aa  565  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
270 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  47.96 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  39.62 
 
 
273 aa  195  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 
259 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
280 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
282 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
282 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  35.2 
 
 
279 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  33.61 
 
 
268 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  35.2 
 
 
279 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
278 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  31.09 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  28.94 
 
 
267 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
263 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
273 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  33.06 
 
 
515 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.61 
 
 
516 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.39 
 
 
515 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  26.94 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
684 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5475  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.72 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
373 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
335 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
362 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.46 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
322 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1716  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsA  29.36 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000743548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
289 aa  58.9  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  28.26 
 
 
344 aa  58.9  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.73 
 
 
326 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.73 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
704 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
335 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  27.91 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
303 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.48 
 
 
380 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  28 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  28.3 
 
 
785 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  28.97 
 
 
412 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  28.97 
 
 
412 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  28.97 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.48 
 
 
853 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.67 
 
 
853 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  28.97 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  28.97 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
321 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  28.97 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.3 
 
 
853 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
307 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
347 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.18 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
317 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 
340 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
350 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
1035 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.52 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  26.79 
 
 
1148 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
573 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
750 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>