More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0608 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
262 aa  544  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  77.91 
 
 
259 aa  430  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  41.37 
 
 
280 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 
280 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  40.75 
 
 
280 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
263 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  38.84 
 
 
268 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
270 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  34.36 
 
 
268 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
282 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 
282 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  33.46 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  34.4 
 
 
515 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32 
 
 
516 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
288 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
270 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  33.83 
 
 
275 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  30.74 
 
 
515 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  34.31 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  33.47 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  33.47 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  33.67 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.1 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.37 
 
 
2401 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
358 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
313 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
891 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.64 
 
 
322 aa  62.4  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
323 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
988 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
785 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  25.11 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
373 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  36.27 
 
 
1119 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
402 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
352 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
326 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
362 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
338 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.58 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.24 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.24 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
335 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
335 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.24 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
336 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
525 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
332 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
419 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
333 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
337 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
1486 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.21 
 
 
339 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  31.52 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
1035 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
684 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.75 
 
 
345 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  30.15 
 
 
332 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
428 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.5 
 
 
312 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.68 
 
 
379 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
393 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  33.63 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.08 
 
 
312 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
376 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
683 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
348 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
373 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  32 
 
 
343 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>