More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2399 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  95.34 
 
 		 280 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  49.06 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  41.37 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  41.6 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.11 
 
 		 516 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  36.19 
 
 		 515 aa  175  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.55 
 
 		 515 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  38.59 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  34.02 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  33.45 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  36.33 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  32.92 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  31.23 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  31.23 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.28 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  23.01 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 891 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.05 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.7 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  27.5 
 
 		 664 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 684 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  28 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  31.48 
 
 		 461 aa  57  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  23.98 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  28 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 1077 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 455 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.8 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.36 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 544 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 884 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 1035 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.8 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.06 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0059  hypothetical protein  36.67 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119267  normal  0.341508 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  21.05 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3670  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  22.43 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 653 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.31 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  28.91 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  31.48 
 
 		 474 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.22 
 
 		 2401 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 328 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.75 
 
 		 344 aa  52.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 341 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>