More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2457 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  52.69 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  48.29 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  47.71 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  43.98 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  40.6 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  41.98 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  42.05 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  43.48 
 
 		 516 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  41.11 
 
 		 515 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  41.37 
 
 		 515 aa  188  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  33.57 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  33.57 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  30.4 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  29.71 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  27.04 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.02 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.39 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 684 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2650  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2511  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.17 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2564  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1624  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1400  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3188  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  35.29 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  35 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.76 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.82 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.11 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.39 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  26.32 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.33 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  33 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 884 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  31.73 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.77 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.7 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2110  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 637 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>