More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3699 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  54.02 
 
 		 282 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  49.44 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  48.29 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  44.19 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  42.91 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  42.8 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  40.55 
 
 		 516 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  39.31 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  40.32 
 
 		 515 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.01 
 
 		 515 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  33.88 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  33.88 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  27.44 
 
 		 272 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  32.65 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 684 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0352  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  25.72 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  34.65 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.32 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  27.03 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 419 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.6 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  31.68 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  28.97 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  25.17 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.13 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3188  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.57 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1624  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.57 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1400  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.57 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.57 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2650  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2564  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2511  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0059  hypothetical protein  35.48 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119267  normal  0.341508 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  26.64 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 1035 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 425 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.3 
 
 		 408 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 324 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.57 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 329 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 1435 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  32.89 
 
 		 672 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.02 
 
 		 312 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 392 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  29.91 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 312 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 317 aa  52  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 338 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 418 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 314 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.21 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  26.89 
 
 		 664 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>