More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1960 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  95.48 
 
 
310 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  80.54 
 
 
318 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  72.37 
 
 
1066 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  73.03 
 
 
315 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  72.37 
 
 
326 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  72.37 
 
 
326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  71.05 
 
 
319 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  69.74 
 
 
319 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  72.89 
 
 
319 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  69.74 
 
 
319 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  69.74 
 
 
319 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  72.86 
 
 
319 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  72.54 
 
 
319 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  53.87 
 
 
317 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
315 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  50 
 
 
310 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  44.21 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  26.67 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.44 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  29.91 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.33 
 
 
700 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
345 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
924 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
487 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.24 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
421 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  21.26 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.18 
 
 
860 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  33.02 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6751  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.89 
 
 
754 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
460 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  27.4 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.89 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  24.73 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24.45 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.56 
 
 
703 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
1077 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.43 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  25.86 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0358  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1678  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4915  family 2 glycosyl transferase  29.84 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 
1739 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.56 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
1119 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.86 
 
 
1132 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  28.23 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
598 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  21.52 
 
 
305 aa  52.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
335 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>