270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0138 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 
302 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 
296 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.88 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  33.33 
 
 
470 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
513 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
528 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  28.7 
 
 
792 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
753 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
924 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.37 
 
 
337 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.07 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  31.51 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
413 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  30.94 
 
 
664 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.03 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  32.89 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.96 
 
 
700 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
525 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  29.36 
 
 
312 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
344 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
344 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
1077 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.32 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
487 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.64 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  24.88 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  28.75 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3950  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
778 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.75941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
785 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.92 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.46 
 
 
326 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.46 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  26.72 
 
 
352 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
327 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
597 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
1297 aa  52.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
322 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.85 
 
 
2401 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
672 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  24.79 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
748 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2736  glycosyltransferase-like protein  25.29 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
315 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  23.73 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
717 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
623 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>