More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3875 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  83.03 
 
 
341 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  72.14 
 
 
343 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  72.33 
 
 
352 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  67.18 
 
 
343 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  63.16 
 
 
352 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  60.51 
 
 
324 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 
368 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  36.76 
 
 
340 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  34.49 
 
 
358 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
330 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  32.91 
 
 
341 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
360 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
355 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
333 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  32.7 
 
 
353 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
329 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.52 
 
 
822 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
329 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  31.31 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
355 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
331 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.73 
 
 
341 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.64 
 
 
337 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.8 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 
1101 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
924 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
475 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
475 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  29.02 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  24.31 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  21.63 
 
 
412 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  21.63 
 
 
412 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  28.67 
 
 
792 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
752 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
280 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
421 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  21.63 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  21.63 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.56 
 
 
1099 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  21.63 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  21.63 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  24.87 
 
 
1015 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.2 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  21.63 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  27.02 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
380 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.94 
 
 
461 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.62 
 
 
403 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
421 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  24.92 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.86 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  28.65 
 
 
458 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
746 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  23.69 
 
 
425 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  23.69 
 
 
425 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
232 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
399 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
354 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
280 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  27.18 
 
 
418 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  21.39 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>