More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0718 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
352 aa  710    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  76.26 
 
 
343 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  77.67 
 
 
341 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  68.88 
 
 
343 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  72.33 
 
 
331 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  62.5 
 
 
352 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  60.13 
 
 
324 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  48.08 
 
 
368 aa  293  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
358 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
360 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  35.26 
 
 
340 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  33.33 
 
 
353 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
355 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  30.86 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
333 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
355 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.93 
 
 
822 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
336 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
341 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
331 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
329 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  29.33 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
316 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.78 
 
 
337 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 
1101 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  41.96 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  28.87 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
637 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  27.8 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  25.94 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
509 aa  69.3  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.71 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  22.08 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  24.08 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.44 
 
 
1099 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  32.48 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  28.62 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
1032 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.8 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 
752 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  25.31 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.02 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.35 
 
 
444 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.84 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.35 
 
 
444 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.35 
 
 
444 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.58 
 
 
441 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
441 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.17 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
441 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
1250 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.03 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.03 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
1120 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.58 
 
 
441 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.17 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
441 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.25 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
924 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  25.08 
 
 
433 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.91 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
746 aa  63.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
353 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 
398 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26 
 
 
461 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.69 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>