More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1291 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
351 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  81.74 
 
 
345 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  60.25 
 
 
326 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  57.23 
 
 
316 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0863  b-glycosyltransferase  32.03 
 
 
345 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.740124  normal  0.0682028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
260 aa  99.8  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.38 
 
 
822 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  29.97 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  32.74 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.87 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  29.78 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  29.65 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
1101 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
1032 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.79 
 
 
461 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
924 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  29.26 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.74 
 
 
792 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  29.06 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.56 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
426 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.03 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
238 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
420 aa  60.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  32.14 
 
 
309 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  20.35 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
307 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.69 
 
 
418 aa  59.7  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
233 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  20.7 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  20.5 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.77 
 
 
941 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.54 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  25.75 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  22.22 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  28.52 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
232 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.55 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
1267 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
232 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  28.23 
 
 
376 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
477 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
368 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
1177 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
1177 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
495 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.85 
 
 
1099 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  23.49 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  25.11 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
275 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>