170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4523 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 336 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  59.05 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  50.78 
 
 		 329 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  50.96 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  44.21 
 
 		 330 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  48.12 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  43.94 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  47.77 
 
 		 353 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  30.61 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  30.67 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  31.09 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  31.71 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 368 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 333 aa  92.4  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.97 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 		 822 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.01 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  31.75 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  27.36 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  23.42 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  29.26 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  30.87 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 284 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  23.84 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23 
 
 		 528 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  30.47 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.26 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  31.76 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.62 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.75 
 
 		 1099 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  29.41 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 1340 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.28 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.81 
 
 		 247 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.97 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  24.82 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  32.41 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  22.52 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  22.29 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.21 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  24.19 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.43 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  24.45 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.12 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.48 
 
 		 257 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37410  glycosyl transferase  29.25 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0782331  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.61 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>