More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1662 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 345 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  81.74 
 
 		 351 aa  554  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  62.42 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  55.95 
 
 		 316 aa  342  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0863  b-glycosyltransferase  33.77 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.740124  normal  0.0682028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.03 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.51 
 
 		 822 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  31.14 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 1032 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 1101 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  28.08 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  28.51 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.55 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  22.29 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 924 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  27.11 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.58 
 
 		 792 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 1177 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 1177 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  29.07 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.97 
 
 		 528 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.42 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  43.68 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.95 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  21.08 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  22.73 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.27 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.45 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  22.65 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  22.65 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.71 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 752 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.91 
 
 		 941 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  28.17 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  27.59 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  19.5 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.5 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>