149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4080 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
401 aa  829    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 
389 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  39.26 
 
 
408 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
368 aa  239  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  39.05 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  36.31 
 
 
364 aa  199  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  29.31 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  28.51 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
345 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  35.92 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
238 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  23.24 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.85 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  28.41 
 
 
442 aa  53.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.07 
 
 
792 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
485 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
485 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
485 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.42 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
307 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.49 
 
 
461 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  22.8 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  21.66 
 
 
464 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
924 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
812 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  33.01 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.62 
 
 
236 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  29.49 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.23 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  34.04 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 
752 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.86 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
310 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  30.13 
 
 
259 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
391 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  35.11 
 
 
362 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
305 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  32.67 
 
 
398 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
225 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
475 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
475 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  30.19 
 
 
421 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
377 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  32.65 
 
 
392 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.8 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  35 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.91 
 
 
864 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  30.19 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  30.19 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3404  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
535 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  48.89 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  23.18 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.42 
 
 
1099 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
236 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.61 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.61 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.1 
 
 
1115 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>