More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3404 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3404  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
339 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0449  glycosyl transferase family protein  49.85 
 
 
334 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0213418  decreased coverage  0.00105166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  22.99 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
362 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  26.28 
 
 
319 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  24.44 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  25.86 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  24.32 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  25.32 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.01 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  23.01 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  22.53 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  23.01 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.01 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  26.84 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  22.98 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4311  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.95 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.536984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  23 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  22.7 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  20.83 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  24.76 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  23.34 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  24.01 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.15 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  23.15 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  21.93 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  25.41 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  22.33 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  27.51 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  27.51 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1389  glycosyl transferase  22.14 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.776961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  22.64 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  23.81 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3309  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0235179  normal  0.32475 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.71 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  25.24 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  25.23 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  25.27 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  25.27 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  25.4 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  23.94 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  23.86 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.92 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>