More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3309 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3309  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
314 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0235179  normal  0.32475 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 
309 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2999  b-glycosyltransferase  37.58 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.221731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
320 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
364 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 
323 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  33 
 
 
323 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  33 
 
 
323 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 
323 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.67 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
356 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 
331 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  32.33 
 
 
312 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3319  glycosyl transferase family protein  42.15 
 
 
307 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.33049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
333 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
339 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.12 
 
 
319 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  34.33 
 
 
319 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  31.37 
 
 
343 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  35.31 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  34.33 
 
 
319 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
347 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
338 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  33.98 
 
 
308 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
336 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  34.87 
 
 
373 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
373 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.23 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  33.44 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  33.11 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
360 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  32.8 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
339 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
335 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
310 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
339 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
319 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
350 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
334 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  32.24 
 
 
320 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
357 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
320 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
362 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
311 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  31.13 
 
 
319 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
311 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
331 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  32.36 
 
 
312 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  32 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
351 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
319 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  32.45 
 
 
350 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  33 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  34.88 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
337 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  31.33 
 
 
353 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
332 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
352 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  31.41 
 
 
312 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
345 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
322 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
309 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3121  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
315 aa  159  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0465511  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
341 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
339 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
321 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
319 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
312 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3097  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
321 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  33.21 
 
 
348 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
327 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1401  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
317 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
336 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
314 aa  155  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  31.44 
 
 
314 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
343 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
348 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  31.13 
 
 
308 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
334 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.37 
 
 
335 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.37 
 
 
335 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.37 
 
 
335 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
340 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.37 
 
 
335 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>