More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3097 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3097  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
321 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2535  glycosyl transferase family 2  60.33 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  39.54 
 
 
319 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  38.89 
 
 
319 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 
363 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 
334 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 
330 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  38.08 
 
 
330 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
366 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 
364 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  36.66 
 
 
310 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  36.92 
 
 
343 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 
347 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
323 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  36.63 
 
 
323 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  37.74 
 
 
346 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.96 
 
 
323 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  36.96 
 
 
323 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  36.96 
 
 
323 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.96 
 
 
323 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 
350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  36.31 
 
 
367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 
339 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
342 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 
335 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
347 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
320 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 
339 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
341 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
340 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 
339 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 
331 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  36.39 
 
 
319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  37.18 
 
 
383 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.93 
 
 
332 aa  215  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  36.18 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  37.95 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  35.81 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0124  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.47 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.854442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  37.38 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  36.81 
 
 
324 aa  211  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0135  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.47 
 
 
326 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00814446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
322 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.48 
 
 
324 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
362 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
334 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 
357 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1389  glycosyl transferase  36.89 
 
 
333 aa  209  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.776961  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.42 
 
 
353 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.42 
 
 
353 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.42 
 
 
353 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.42 
 
 
319 aa  207  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
348 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
338 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
347 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.76 
 
 
308 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
346 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 
312 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  38.26 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
339 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
356 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
347 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
347 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
347 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
312 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  36.66 
 
 
336 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  37.94 
 
 
312 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  37.19 
 
 
312 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  34.06 
 
 
337 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
365 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
365 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  35.67 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  34.75 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  36.93 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 
347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  35.67 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  34.64 
 
 
348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
309 aa  200  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
334 aa  198  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
343 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1700  glycosyltransferase-like protein  35.03 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  40.4 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>