More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3319 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3319  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
307 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.33049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3309  glycosyl transferase family protein  42.15 
 
 
314 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0235179  normal  0.32475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2999  b-glycosyltransferase  36.33 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.221731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
309 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
310 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  38.74 
 
 
324 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
339 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.52 
 
 
332 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  35.39 
 
 
330 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
324 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
323 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
323 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  26.69 
 
 
323 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
323 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  34.82 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
336 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
312 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  37.39 
 
 
324 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  32.77 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  31.82 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  33.47 
 
 
343 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
350 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 
319 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  30.45 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  32.93 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  32.81 
 
 
373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  33.06 
 
 
367 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
335 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  31.09 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
339 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  30.96 
 
 
320 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
356 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
387 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
327 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
351 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
345 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
335 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  31.89 
 
 
353 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  32.65 
 
 
346 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
308 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
334 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
311 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
311 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
353 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
383 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
353 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
353 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  31.09 
 
 
337 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
312 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
357 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
339 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
319 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  29.67 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  31.11 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  30.67 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
348 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
347 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.45 
 
 
327 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
342 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.45 
 
 
327 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.45 
 
 
327 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.45 
 
 
327 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.45 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  32.44 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
664 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  42.18 
 
 
314 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
331 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
312 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0170  glycosyltransferase-like protein  29.75 
 
 
310 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000142505  hitchhiker  7.37395e-16 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.7 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>