232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0604 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  100 
 
 
340 aa  685    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
331 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  36.08 
 
 
341 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  39.37 
 
 
324 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  37.03 
 
 
343 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  35.26 
 
 
352 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
352 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
360 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  35.49 
 
 
368 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
333 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  36.34 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
329 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.54 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
358 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
329 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  31.58 
 
 
341 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
329 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
330 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  30.46 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
355 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
336 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
316 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.94 
 
 
822 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  27.64 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.58 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.01 
 
 
1101 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.72 
 
 
260 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  21.96 
 
 
927 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  21.57 
 
 
872 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
366 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.31 
 
 
1115 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.31 
 
 
1119 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.31 
 
 
1115 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.31 
 
 
1115 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
482 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
258 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  21.24 
 
 
528 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
227 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
293 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
297 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
297 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
501 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3114  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
244 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00091286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10440  glycosyl transferase  33.08 
 
 
356 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
237 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  23.56 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.49 
 
 
1115 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  28.46 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  22.27 
 
 
272 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  34.07 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
384 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  27.85 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
364 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
662 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  33.04 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 
789 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 
789 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 
789 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
1032 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.57 
 
 
1157 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.82 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.99 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  23.53 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  33.33 
 
 
672 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
1739 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 
509 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
756 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
336 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>