More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1029 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
360 aa  725    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  36.23 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  38.3 
 
 
352 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
331 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  38.23 
 
 
343 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  37.91 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  37.69 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
352 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
389 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.81 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
368 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  34.36 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  28.62 
 
 
351 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
331 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
330 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  29.91 
 
 
341 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
355 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.24 
 
 
337 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.3 
 
 
822 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.72 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  24.52 
 
 
452 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.72 
 
 
1101 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  31.05 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
420 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  39.81 
 
 
694 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  29.37 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.23 
 
 
927 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.64 
 
 
872 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.17 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  42.71 
 
 
812 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 
1124 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  26.69 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
1002 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
232 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.08 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
549 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.22 
 
 
1099 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.23 
 
 
1115 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.23 
 
 
1119 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
672 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0842  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.752789  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.23 
 
 
1115 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 
1115 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
283 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
501 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  29.03 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  29.39 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
924 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 
1115 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
324 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  24.18 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
233 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
1015 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>