147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2894 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  63 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  52.49 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  58.08 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  56.42 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  55.92 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  51.01 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.23 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 477 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 358 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  27.83 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 924 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  29.41 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  25.94 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  28.87 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.09 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  29.58 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  27.98 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.41 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.23 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  24.92 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.71 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  26.51 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  25.62 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.65 
 
 		 754 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.21 
 
 		 1099 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  22.32 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  30.07 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 1152 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 470 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 426 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 		 362 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  24.43 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  22.16 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 1340 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 598 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 635 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>