142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0621 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  63 
 
 
316 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  54.37 
 
 
334 aa  347  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  57.79 
 
 
337 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  57.53 
 
 
300 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  58.43 
 
 
313 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  54.17 
 
 
317 aa  285  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
331 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
597 aa  92.8  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.91 
 
 
337 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
477 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  29.32 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  27.2 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
623 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  26.91 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.81 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.9 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
924 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  21.55 
 
 
528 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  26.38 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  28.71 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
296 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  25.27 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  28.29 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  42.67 
 
 
598 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  27.64 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
374 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  27.84 
 
 
315 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.67 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
703 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.62 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 
355 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
421 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
748 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
753 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
470 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  26.95 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 
316 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
1077 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
994 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
329 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  20.57 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
487 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
892 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
1152 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
808 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
259 aa  45.8  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
662 aa  45.8  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
394 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  37.97 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
1340 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  21.82 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.67 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1739 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  25.23 
 
 
822 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
725 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>