More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3564 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 389 aa  761    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  36.69 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  36.61 
 
 		 324 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  31.79 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  32.12 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  31.94 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  31.63 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.92 
 
 		 341 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 330 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  30.61 
 
 		 353 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 		 329 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  28.47 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.6 
 
 		 822 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.87 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  25.98 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.82 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.01 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  23.54 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  23.54 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  23.54 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  23.54 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  23.54 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.79 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.27 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.27 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.27 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.16 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 549 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 752 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.88 
 
 		 1099 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.91 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25.27 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  26.56 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  20.62 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  20.13 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.59 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  27 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.67 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  25.52 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  25.99 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  26.13 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  33.33 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.46 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.54 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  24.23 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  26.91 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 246 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  26.91 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 		 344 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  26.91 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 1101 aa  56.6  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.4 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  30.36 
 
 		 694 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  27.12 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 1435 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>