194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0203 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
313 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  96.81 
 
 
313 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  84.44 
 
 
315 aa  517  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  47.81 
 
 
296 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  46.57 
 
 
294 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  46.72 
 
 
284 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 
283 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
290 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  40.14 
 
 
283 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  40.91 
 
 
275 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  41.32 
 
 
287 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  40.96 
 
 
283 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  39.07 
 
 
300 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  37.77 
 
 
301 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  40.67 
 
 
288 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  37.41 
 
 
664 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  29.83 
 
 
327 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  29.41 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
891 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
684 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  25.2 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
328 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
259 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
477 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  23.02 
 
 
515 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
455 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
425 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  26.02 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  23.89 
 
 
267 aa  55.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  30 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
341 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  32.89 
 
 
474 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  20.55 
 
 
516 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
924 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  24.02 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  28.97 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
328 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
348 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.2 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  25.56 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  22.18 
 
 
515 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  31.94 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  30.36 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  32.85 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  29.38 
 
 
740 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
597 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3440  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
344 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  34.55 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
884 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
836 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
834 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
340 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.12 
 
 
283 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  20 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
501 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  22.94 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2591  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.642506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2244  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>