252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1076 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 305 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  74.75 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  45.55 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  34.54 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  29.7 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  33.48 
 
 		 642 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  30.13 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  35.32 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.8 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.8 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.27 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.86 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.03 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  24.23 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.15 
 
 		 754 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  28.96 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  21.46 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.67 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  34.85 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  23.3 
 
 		 1065 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  24.58 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  21.19 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  26.67 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  21.86 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  29.41 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>