195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4958 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 309 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  55.84 
 
 		 310 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  54.24 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  45.33 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  45.15 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  34.77 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  35.62 
 
 		 642 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  27.97 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.45 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  19.89 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  21.79 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  19.89 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.87 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  19.89 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.24 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  22.47 
 
 		 1065 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 454 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  19.4 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0844  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.649715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 477 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  25.71 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  18.78 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  25.1 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  22.68 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.36 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  22.95 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>