218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3185 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
305 aa  634    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  74.75 
 
 
305 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  44.22 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
326 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  34.54 
 
 
326 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
296 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
316 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  29.9 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
326 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
306 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
317 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
326 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
326 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
308 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
314 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  32.77 
 
 
338 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
323 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  32.62 
 
 
642 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
337 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  35.32 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.46 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.46 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  24.79 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.86 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
394 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  22.14 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.45 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
454 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.37 
 
 
754 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
455 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  29.17 
 
 
1065 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  25.79 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
460 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  25.29 
 
 
1041 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  23 
 
 
597 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  26.73 
 
 
283 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.06 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.96 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
748 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
924 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
392 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
444 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>