More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001813 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 
270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  49.44 
 
 
263 aa  262  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  45.28 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  45.63 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  46.56 
 
 
282 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  47.71 
 
 
288 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  45.7 
 
 
516 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  46.64 
 
 
515 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  41.29 
 
 
268 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  45.06 
 
 
515 aa  215  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
259 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
280 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
280 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
280 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  28.94 
 
 
272 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
270 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  30.71 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  30.71 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  29.48 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
278 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  33.06 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.71 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.58 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  31.41 
 
 
343 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  41.24 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
684 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.31 
 
 
326 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.77 
 
 
379 aa  62.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
341 aa  62  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  32 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
1435 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
544 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
344 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
344 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
316 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.7 
 
 
326 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.52 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  25.42 
 
 
664 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
1035 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  37.23 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 
362 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  29.41 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
322 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
360 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
326 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
584 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  30.91 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
785 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25.1 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0611  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.04 
 
 
490 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  30.69 
 
 
321 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  31.82 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  32.26 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  36.63 
 
 
391 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>