160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0247 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  100 
 
 
279 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  100 
 
 
279 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  49.26 
 
 
278 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 
259 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  35.77 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  35.74 
 
 
268 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
262 aa  132  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  35.2 
 
 
272 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
288 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
273 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  31.75 
 
 
515 aa  122  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  31.73 
 
 
516 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  30.71 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  28.01 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  31 
 
 
515 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
270 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  27.98 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  32.71 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
1077 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
419 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.41 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
374 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
684 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  23.45 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 
326 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
393 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  26.77 
 
 
461 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.79 
 
 
326 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.79 
 
 
326 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  29.51 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.67 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.39 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
303 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  28.12 
 
 
360 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
358 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  34.62 
 
 
418 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.52 
 
 
754 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  24.07 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
1002 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
340 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.73 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  29.29 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.26 
 
 
322 aa  46.6  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
393 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  22.66 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.25 
 
 
2401 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
425 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  28.43 
 
 
785 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  23.97 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
348 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
352 aa  45.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  20.23 
 
 
294 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  25.62 
 
 
423 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  27.78 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  25.81 
 
 
216 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>