More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3224 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
273 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  34.31 
 
 
268 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  35 
 
 
268 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
263 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
278 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
282 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.84 
 
 
516 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
259 aa  141  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  35.15 
 
 
515 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
270 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.79 
 
 
515 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  34.23 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  31.16 
 
 
267 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
270 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  32.66 
 
 
279 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  32.66 
 
 
279 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  30.15 
 
 
272 aa  118  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  28 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.51 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
1077 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
405 aa  62.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.7 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  33.63 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1716  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsA  30.93 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000743548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  29.41 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.89 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
313 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
315 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  33.05 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.7 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
684 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
1156 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
312 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
347 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
331 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
344 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  36.7 
 
 
785 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
335 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
1162 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  31.82 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  35.48 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  31.82 
 
 
344 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  37.61 
 
 
1157 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
345 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  35.54 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
445 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  30.91 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
310 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  31.82 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  34.26 
 
 
321 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  31.82 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  31.43 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
337 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
305 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
310 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
230 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
1486 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.17 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
785 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.66 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
402 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.66 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>