More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0388 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  54.34 
 
 
268 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  46.77 
 
 
267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  46.39 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  45.42 
 
 
515 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  44.27 
 
 
516 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  44.66 
 
 
515 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  41.54 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  42.91 
 
 
263 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  40.91 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  41.98 
 
 
288 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
270 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
280 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
280 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
273 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  32.96 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  33.05 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  32.8 
 
 
279 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  32.8 
 
 
279 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
270 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
684 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  26.67 
 
 
474 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  39.22 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  29.79 
 
 
341 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.09 
 
 
326 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.93 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  23.67 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.25 
 
 
326 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
315 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.25 
 
 
326 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1210  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  37 
 
 
946 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255767  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.07 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
362 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25.22 
 
 
316 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
1032 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  32.79 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
581 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.48 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3670  glycosyl transferase family 2  20.75 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  25.32 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
891 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.49 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  32.46 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
750 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
326 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
250 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
1177 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
326 aa  52.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  25.2 
 
 
303 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
1177 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.35 
 
 
272 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.41 
 
 
851 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
428 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
329 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.35 
 
 
851 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.35 
 
 
851 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  28.35 
 
 
851 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.35 
 
 
851 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
306 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
331 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.88 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0309  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0435419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
419 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
760 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>