188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0331 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  49.26 
 
 
279 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  49.26 
 
 
279 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
273 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  34.41 
 
 
275 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
259 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  32.48 
 
 
272 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  29.89 
 
 
268 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
270 aa  125  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
280 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
263 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
282 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.09 
 
 
516 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  33.46 
 
 
515 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
288 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  30.08 
 
 
515 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  31.6 
 
 
267 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  26.95 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  37.01 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
419 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  33.33 
 
 
2401 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
345 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.22 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
525 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 
684 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
425 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
335 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24.22 
 
 
339 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
348 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  21.83 
 
 
700 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
1007 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  30.63 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.88 
 
 
754 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.23 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
812 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 
340 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  27.45 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
335 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.26 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.26 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  32.26 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.67 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  24.52 
 
 
474 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.26 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.34 
 
 
312 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  27.5 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  29.41 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  27.04 
 
 
302 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  19.15 
 
 
428 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5475  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.66 
 
 
1157 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
374 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.95 
 
 
316 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
373 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
322 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
327 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
311 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
327 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.08 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.08 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.37 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.32 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
891 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1376  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0850607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
397 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.37 
 
 
326 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>