More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1547 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  43.68 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  43.07 
 
 		 268 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  46.56 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  43.56 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  41.54 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  43.98 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  42.41 
 
 		 515 aa  206  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  42.75 
 
 		 516 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  39.85 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  40.78 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 		 259 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  30.15 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  32.05 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  32.05 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  32.64 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 684 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.21 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.85 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  23.27 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  26.5 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  22.61 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  33.33 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  33.33 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 584 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  36.84 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 		 785 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  27.56 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  32.65 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  32.65 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  32.65 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  32.65 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  32.65 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.71 
 
 		 946 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.79 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.69 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  26.27 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 891 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.01 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.6 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  40.21 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  31.31 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.38 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  32.65 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.38 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  31.63 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.55 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2170  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 532 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 501 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>