More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3186 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3186  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 322 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  80.77 
 
 		 312 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  56.54 
 
 		 288 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2546  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3567  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2963  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2871  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4273  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2775  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0722  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.178232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1115  glycosyltransferase  26.67 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  26.96 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.97 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 1032 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 1120 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 397 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 1038 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 1115 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  26.26 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  26.36 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.26 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 1118 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  23.21 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  26.26 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  26.26 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  26.26 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 475 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  26.26 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  26.32 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  31.67 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 1154 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 1035 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 1250 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.4 
 
 		 1099 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 429 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 584 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1813  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.37725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 501 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.69 
 
 		 872 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 		 927 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.43 
 
 		 1115 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.43 
 
 		 1119 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.43 
 
 		 1115 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.35 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.07 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.97 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 		 1115 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  22.1 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 475 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 475 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.6 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 		 497 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 1162 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>