More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0614 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
529 aa  1047    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
322 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
302 aa  96.7  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
609 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
315 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
362 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
317 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.81 
 
 
326 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  28.24 
 
 
314 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.48 
 
 
326 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
313 aa  91.3  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  43.1 
 
 
307 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
386 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
316 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.74 
 
 
326 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.18 
 
 
326 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
300 aa  88.6  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.27 
 
 
256 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
326 aa  87.4  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
581 aa  87  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
303 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  40.65 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.38 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13951  putative glycosyl transferase  25.88 
 
 
313 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.759655  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
324 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
314 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
338 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0081  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
605 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
325 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  35.51 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
332 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
146 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  35.51 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  34.01 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  34.78 
 
 
344 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.42 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  45.26 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
847 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  34.01 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  34.06 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  35.51 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  34.06 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  34.06 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  35.51 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
746 aa  80.5  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0409  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
363 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.33 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.08 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
326 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
310 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
331 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
326 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  27.75 
 
 
306 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  38.74 
 
 
325 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
351 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
235 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
302 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
672 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.83 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.83 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>