207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2271 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
555 aa  1085    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  45.07 
 
 
512 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  39.15 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  39.31 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  40.04 
 
 
566 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0882  family 2 glycosyl transferase  39.01 
 
 
557 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1640  hypothetical protein  39.28 
 
 
567 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52354  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1648  glycosyltransferase-like protein  37.2 
 
 
538 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323978  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0635  family 2 glycosyl transferase  39.4 
 
 
513 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
547 aa  226  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0883  family 2 glycosyl transferase  36.9 
 
 
524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
333 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
684 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  28.4 
 
 
822 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  30.71 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
310 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
477 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
300 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  31.72 
 
 
461 aa  60.5  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  21.32 
 
 
342 aa  60.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
328 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
528 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
284 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
293 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
310 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
322 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  32.02 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
304 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.68 
 
 
321 aa  54.7  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
301 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
236 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
327 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
327 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25 
 
 
327 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 
247 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.06 
 
 
326 aa  53.9  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
349 aa  53.9  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
315 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
455 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.7 
 
 
327 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
327 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
346 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  21.94 
 
 
272 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
470 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
232 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 
355 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
236 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.13 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.19 
 
 
310 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
350 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
338 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.53 
 
 
327 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  32.35 
 
 
314 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
235 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.4 
 
 
341 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  25.66 
 
 
235 aa  51.2  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
470 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
260 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
333 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
366 aa  50.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
573 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
573 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
597 aa  50.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
239 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
314 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
331 aa  50.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
313 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.27 
 
 
337 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  21.25 
 
 
294 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  28.88 
 
 
310 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.38 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
1486 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
380 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
334 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
641 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  34.58 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
723 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
365 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
352 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  37.11 
 
 
378 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
312 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
299 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  26.85 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
318 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
268 aa  48.5  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0476  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
534 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>