More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0883 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0883  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
524 aa  1028    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1648  glycosyltransferase-like protein  61.35 
 
 
538 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323978  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0882  family 2 glycosyl transferase  48.22 
 
 
557 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1640  hypothetical protein  48.71 
 
 
567 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52354  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  45.32 
 
 
566 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 
551 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  43.69 
 
 
573 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0635  family 2 glycosyl transferase  41.87 
 
 
513 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
547 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
555 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  35.78 
 
 
512 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
684 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
884 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.09 
 
 
309 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
304 aa  67  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
1015 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
347 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  37.37 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
470 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 
419 aa  63.5  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  28.19 
 
 
470 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
477 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
327 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
891 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
528 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
326 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
337 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
1077 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  26.73 
 
 
311 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
247 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
301 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
302 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  29.86 
 
 
474 aa  57.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
272 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
327 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
328 aa  57  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
289 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
236 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
284 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
689 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.44 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.44 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
316 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
256 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
1035 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 
672 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.29 
 
 
337 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
266 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
300 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  21.83 
 
 
342 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
334 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
235 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
289 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
310 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
597 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
344 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
352 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  32.28 
 
 
410 aa  54.3  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
327 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.96 
 
 
327 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
310 aa  54.3  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
374 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  23.69 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
267 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
626 aa  53.5  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
333 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
691 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
256 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
314 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  24.25 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  33.71 
 
 
333 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
365 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
691 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  35.16 
 
 
334 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
341 aa  52.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  28.24 
 
 
461 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
236 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
324 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.48 
 
 
327 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
513 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
318 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.47 
 
 
461 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
315 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
410 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.16 
 
 
652 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
308 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  34.88 
 
 
410 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 
655 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>