213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4583 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 547 aa  1082    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0635  family 2 glycosyl transferase  45.89 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 		 551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0882  family 2 glycosyl transferase  43.38 
 
 		 557 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  43.96 
 
 		 566 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1640  hypothetical protein  44.68 
 
 		 567 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52354  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  38.59 
 
 		 573 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1648  glycosyltransferase-like protein  38.95 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 555 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0883  family 2 glycosyl transferase  38.91 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  35.51 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 		 419 aa  100  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  30.97 
 
 		 474 aa  67  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.69 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.35 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  30.5 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.33 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.91 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 672 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 641 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 738 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.91 
 
 		 326 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 		 327 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 		 327 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 		 327 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 327 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.6 
 
 		 327 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.71 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.71 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 338 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 236 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 1015 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 300 aa  53.5  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 318 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 345 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 324 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 350 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 352 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  22.07 
 
 		 333 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 328 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  21.76 
 
 		 746 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 1101 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  30.7 
 
 		 391 aa  51.2  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  36.89 
 
 		 785 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 		 331 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0494  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 674 aa  50.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 349 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 380 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 703 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  22.49 
 
 		 289 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 324 aa  50.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  29.25 
 
 		 296 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  20.47 
 
 		 358 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 235 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 891 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 270 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 272 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.6 
 
 		 1644 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.6 
 
 		 1644 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 232 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 683 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.27 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 301 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  29.34 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 322 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 689 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>